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科學(xué)島團(tuán)隊(duì)在微流控CRISPR-Dx檢測(cè)流感病毒分型研究方面取得新進(jìn)展

中國(guó)科學(xué)院合肥物質(zhì)科學(xué)研究院 2024-07-04
近日,中國(guó)科學(xué)院合肥物質(zhì)院安光所光電子中心生物醫(yī)學(xué)光學(xué)團(tuán)隊(duì)在微流控CRISPR分子診斷新方法研究方面取得新進(jìn)展。相關(guān)成果以《SEDphone: 空間編碼離心式微流控芯片-智能手機(jī)平臺(tái)聯(lián)合RT/LAMP-CRISPR/Cas12a體系用于流感病毒分型檢測(cè)》為題發(fā)表于化學(xué)類TOP期刊Sensors and Actuators: B. Chemical上。
 
  流感病毒是一種嚴(yán)重的公共衛(wèi)生威脅,每年都會(huì)引起流行病,發(fā)病率和死亡率較高,特別是季節(jié)性流感爆發(fā)時(shí),大批患者涌入社區(qū)和醫(yī)院門診,給醫(yī)療機(jī)構(gòu)帶來(lái)巨大壓力。同時(shí),流感病毒極易發(fā)生變異,表現(xiàn)出多種亞型,不同亞型需要采取不同的臨床干預(yù)措施。因此,迫切需要開發(fā)一種準(zhǔn)確、快速和便攜的解決方案來(lái)區(qū)分不同流感病毒亞型,控制病毒傳播及指導(dǎo)臨床合理用藥。
 
  CRISPR/Cas分子診斷技術(shù),由于其特異性強(qiáng)、反應(yīng)效率高和便攜性好的特點(diǎn),被稱為最有可能替代PCR的下一代分子診斷技術(shù)。團(tuán)隊(duì)將LAMP等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)和CRISPR/Cas12a技術(shù)進(jìn)行“雙劍合璧”,靶標(biāo)序列經(jīng)過(guò)LAMP擴(kuò)增后被CRISPR/Cas12a識(shí)別,并激活其反式切割的活性,進(jìn)而切割報(bào)告探針,釋放熒光信號(hào)。該方法既保證了檢測(cè)的高靈敏度,又彌補(bǔ)了LAMP擴(kuò)增過(guò)程中假陽(yáng)性的問(wèn)題。為了便于不同靶標(biāo)的應(yīng)用,研究人員基于LAMP-CRISPR/Cas12a系統(tǒng)開發(fā)了一個(gè)通用的設(shè)計(jì)過(guò)程模型。經(jīng)優(yōu)化后,可在45分鐘內(nèi)同時(shí)檢測(cè)H1N1、H3N2、H5N1、H7N9和乙型流感病毒(IBV) 5種流感分型,檢測(cè)限達(dá)到10拷貝/μL,達(dá)到金標(biāo)準(zhǔn)水平。
 
  另外,為了實(shí)現(xiàn)LAMP擴(kuò)增及CRISPR檢測(cè)的一體化操作,研究人員設(shè)計(jì)并制備了具有空間編碼功能的離心式微流控芯片,開發(fā)了基于智能手機(jī)的便攜式床旁檢測(cè)(point of care testing, POCT)設(shè)備SEDphone,實(shí)現(xiàn)了多種流感分型的“同時(shí)擴(kuò)增,同時(shí)檢測(cè)”。同時(shí),采用雙溫區(qū)設(shè)計(jì),克服了RT/LAMP與CRISPR/Cas12a技術(shù)反應(yīng)溫度差異的問(wèn)題。采用臨床樣本驗(yàn)證了LAMP-CRISPR/Cas12a流感病毒快速分型方法及SEDphone平臺(tái)的臨床實(shí)用性。該項(xiàng)研究為多種病原體的高靈敏、準(zhǔn)確、快速、即時(shí)檢測(cè)提供一種新思路,有望用于發(fā)熱門診或是家庭自檢,可最大限度地降低了不必要的交叉感染風(fēng)險(xiǎn),緩解醫(yī)療壓力。
 
  博士研究生尹雪兒為論文第一作者,朱燦燦副研究員、朱靈研究員和劉勇研究員為論文通訊作者。該項(xiàng)工作得到國(guó)家重點(diǎn)研發(fā)計(jì)劃、中國(guó)科學(xué)院青促會(huì)優(yōu)秀會(huì)員及合肥物質(zhì)院院長(zhǎng)基金高技術(shù)創(chuàng)新項(xiàng)目支持。
 
圖 SEDphone流感病毒檢測(cè)平臺(tái)工作流程示意圖
 
  圖 LAMP- CRISPR/Cas12a檢測(cè)不同流感病毒分型特異性及靈敏度評(píng)估
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